员工生病住院时，以下特殊情况会影响公司补贴处理：
1、需延长医疗期的情形。依据《关于贯彻〈企业职工患病或非因工负伤医疗期规定〉的通知》，患癌症、精神病、瘫痪等特殊疾病的职工，24个月内未痊愈的，经企业和劳动主管部门批准可延长医疗期。符合此情形，公司须批准延长并支付延长期间病假工资，否则违法。
2、公司特殊福利情形。部分公司除法定病假工资外，另有住院补贴（如固定日补）、医疗费用报销（如社保外补助）等福利。员工可同时享受法定病假工资和公司福利，公司不能以已付病假工资为由拒发约定福利。
3、试用期或劳务派遣情形。试用期员工享有医疗期和病假工资，但部分公司误认试用期无此权益而拒付；劳务派遣员工病假工资通常由用工单位承担或按派遣协议约定处理，协议未明确时易导致用工单位与派遣单位推诿，影响员工补贴获取。
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员工生病住院公司是否有补贴，需结合法律规定和实际情况判断。一般而言，公司应支付病假工资并保障医疗期。
法定医疗期内，公司需按员工实际工作年限和本单位工作年限支付病假工资：医疗期3 - 24个月不等，病假工资不低于当地最低工资标准的80%（具体依地方规定）。若劳动合同约定或公司政策有更高病假补贴，公司应依约定或政策执行。超出法定医疗期且无法从事原工作的，公司可依法解除合同，但需支付经济补偿。
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员工生病住院公司是否有补贴，《劳动法》《企业职工患病或非因工负伤医疗期规定》等法律法规已明确规定：
《劳动法》第七十三条：劳动者患病依法享受社会保险待遇。
《企业职工患病或非因工负伤医疗期规定》第三条：职工因患病停止工作医疗时，依本人实际工龄和本单位工龄，给予3 - 24个月医疗期。
《关于贯彻执行〈劳动法〉若干问题的意见》第59条：医疗期内公司应支付病假工资或疾病救济费，可低于最低工资标准但不低于80%。综上，员工处于法定医疗期内，公司必须支付不低于最低工资标准80%的病假工资，此为法律强制规定，公司不得拒绝。
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员工生病住院期间，需提前防范以下法律风险：
1、公司拒付/拖欠病假工资风险。如员工王某因肺炎住院2个月（工龄对应医疗期3个月），公司以“未实际出勤”为由拒发病假工资。法律规定，王某医疗期内有权获不低于当地最低工资标准80%的病假工资，公司拒付违法，王某可通过劳动仲裁追讨。
2、医疗期认定争议风险。员工李某本单位工龄3年、实际工龄6年，法定医疗期应为6个月，但公司以“内部规定医疗期统一3个月”为由拒绝延长。公司内部规定因违反法律强制性规定无效，李某可主张6个月医疗期；若公司因此解除合同，需支付违法解除赔偿金。

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